蛋白全序列分析——復達客戶檢測案例
2021年10月15日,客服中心反饋上海某法院有一則知識產權糾紛案件,涉及到蛋白質的專利序列,需要進行蛋白質一級結構鑒定。蛋白質實驗室工程師第一時間與客戶進行詳細溝通,情況如下:
上海某法院承擔了改革先行先試的任務,按照知識產權專業化審判的規律,積極探索和推進改革,設立專業化審判組織、建立多元化技術事實查明制度體系、建立技術調查官制度、建立專業智庫、開展專業化司法公信力評估,以信息化促進改革、提供便民訴訟服務,取得了階段性成效。在服務創新驅動發展戰略、服務自貿區建設、服務上海建設具有全球影響力的科技創新中心大局中,充分發揮知識產權司法保護主導作用,得到了人大代表、政協委員和國際同行的普遍贊譽和充分肯定。
ICA固定化頭孢菌素C酰化酶
客戶是上海某法院,幫助當事人雙方尋求機構進行蛋白質一級結構檢測。客戶之前做過很多次測試,但是數據結果都不理想。序列覆蓋率都不能達到100%,無法判斷樣品的實際一級序列。客戶找到我們,希望出完整的方案,并進行測試。
簽訂合同后,蛋白質實驗室工程師第一時間對理論序列進行分析,確定了3種針對理論序列的特殊蛋白酶。基于LCMS/MS平臺分析ICA固定化頭孢菌素C酰化酶全序列。針對樣品理論序列,設計適用的多種蛋白酶,蛋白質通過多種酶切后,裂解成多種小分子多肽片段。本項目使用NanoLC-Obitrap 質譜儀對多肽片段進行解析,樣品被離子化后進入質譜儀,得到一級質譜圖后,篩選母離子進行二級質譜圖解析肽段序列。最后根據理論序列綜合分析比對得出蛋白質的一級氨基酸序列。
客戶對數據非常認可,序列覆蓋率達到100%。